- a -

• AlignedBases : BamTools::BamAlignment
• AlignmentFlag : BamTools::BamAlignment
• AssemblyID : BamTools::SamSequence

- b -

• Bin : BamTools::BamAlignment

- c -

• Checksum : BamTools::SamSequence
• CigarData : BamTools::BamAlignment
• CommandLine : BamTools::SamProgram
• Comments : BamTools::SamHeader

- d -

• Description : BamTools::SamReadGroup

- f -

• Filename : BamTools::BamAlignment
• FlowOrder : BamTools::SamReadGroup

- g -

• GroupOrder : BamTools::SamHeader

- i -

• ID : BamTools::SamProgram , BamTools::SamReadGroup
• InsertSize : BamTools::BamAlignment

- k -

• KeySequence : BamTools::SamReadGroup

- l -

• LeftPosition : BamTools::BamRegion
• LeftRefID : BamTools::BamRegion
• Length : BamTools::SamSequence , BamTools::CigarOp , BamTools::BamAlignment
• Library : BamTools::SamReadGroup

- m -

• m_errorString : BamTools::IBamIODevice
• m_mode : BamTools::IBamIODevice
• MapQuality : BamTools::BamAlignment
• MatePosition : BamTools::BamAlignment
• MateRefID : BamTools::BamAlignment

- n -

• Name : BamTools::BamAlignment , BamTools::SamSequence , BamTools::SamProgram

- p -

• PlatformUnit : BamTools::SamReadGroup
• Position : BamTools::BamAlignment
• PredictedInsertSize : BamTools::SamReadGroup
• PreviousProgramID : BamTools::SamProgram
• ProductionDate : BamTools::SamReadGroup
• Program : BamTools::SamReadGroup
• Programs : BamTools::SamHeader

- q -

• Qualities : BamTools::BamAlignment
• QueryBases : BamTools::BamAlignment

- r -

• ReadGroups : BamTools::SamHeader
• RefID : BamTools::BamAlignment
• RefLength : BamTools::RefData
• RefName : BamTools::RefData
• RightPosition : BamTools::BamRegion
• RightRefID : BamTools::BamRegion

- s -

• Sample : BamTools::SamReadGroup
• Sequences : BamTools::SamHeader
• SequencingCenter : BamTools::SamReadGroup
• SequencingTechnology : BamTools::SamReadGroup
• SortOrder : BamTools::SamHeader
• Species : BamTools::SamSequence

- t -

• TagData : BamTools::BamAlignment
• Type : BamTools::CigarOp

- u -

• URI : BamTools::SamSequence

- v -

• Version : BamTools::SamHeader , BamTools::SamProgram